在临床相关研究方面，眼底专科开展了增生性玻璃体视网膜病变发病机制的研究，视网膜下人工假体植入技术及组织相容性研究，高度近视眼致病基因定位及蛋白质组学分析，黄斑营养不良的致病基因定位研究，年龄相关性黄斑变性发病危险因素和早期干预研究，以及眼病的流行病学研究等。持续不断的获得了多项及省部级课题经费的支持。发表了系列高质量研究论文，形成了同仁品牌效应和国际影响力。北京同仁医院眼底专科坚持以临床服务为根本，以科研创新为导向，医疗、教学、科研、预防发展的目标，推动了创新型的科学研究工作的持续开展和学科临床服务水平的不断提高。
青光眼科有博士研究生导师一人，硕士研究生导师两人;有正高级职称人员5人，副高级职称人员人9人;青光眼科常年承担首都医科大学及首都医科大学国际学院本科生、研究生、国际学生的临床授课任务;青光眼科每日的平均门诊病人量200-300人次，科室开放床数52张，年手术量超过3000台，青光眼科住院部的床位使用率常年超过，术前平均住院日低于4天，各项医疗指标位居全国前列。其中2/3的患者来自外地，每年培养研究生和进修医生近百名。
北京同仁医院眼外伤专科成立于1968年，是国内早成立的集临床、科研、教学于一体的眼外伤专科。北京同仁眼外伤专科技术力量雄厚，学科梯队合理，拥有包括多位经验丰富、享有盛誉的专家和教授在内的近20名副主任医师以上职称的高级专业人才。每月专家门诊量在1700人次以上，固定病床50余张，年手术量达5000人次以上。
角膜塑形镜门诊现设立在北京同仁医院崇文门院区东区一楼视光中心门诊，隶属眼科医学视光中心，现有医生6人，均为副高以上职称，专业擅长为眼视光医学及角膜病学，在复杂角膜屈光问题，近视眼防控，角膜塑形镜验配，硬性角膜接触镜(RGP)验配等领域具有丰富的临床经验。
服务人群：18-55岁的近视、散光、远视等屈光不正，希望通过手术矫正获得更好视觉体验的患者。