预付保函又称还款保函（repayment guarantee）及退款保函，在贸易合同中还可以称为定金保函（down-payment guarantee）。在大额交易中，买方或业主在合约签订后的一定时间内预先需向供货方支付一定比例的款项作为执行合同的启动资金，由于该款项是对供货方在履约之前所作的预付，买方为了避免日后由于供货方拒绝履行义务或者无法履行义务，却不退款而无端遭到损失，通常要求供货方在买方预付之前的若干日内通过其银行开出预付保函，由银行作出承诺，一旦申请人未能履约或者是无法全部履约（不管这种行为是有意的或者是无意造成的），担保行将在收到买方提出的索赔后，向其返还这笔与预付金额等值的款项，或者相当于合约尚未履行部分相当比例的预付金额，使买方能够顺利的收回所预付的款项。
商业保函简单来说就是商业机构信用担保保证书。
商业保函的官方定义是由除银行以外的，实力雄厚的商业机构出具的保函，一般多为专业担保公司开具的公司保函,是商业机构信用担保。包括程担保公司出具的投标保函，履约保函，预付款保函，质量保函，农民工工资支付保函，都为商业保函。商业保函是以商业机构信用为担保，承担人是商业机构，属于商业信用。
商业保函和银行保函具有同样的法律效益，不过商业保函比银行保函更便宜，办理手续更简便，免收保证金，只收取担保费，所以更多人会选择商业保函。
商业保函与银行保函有什么区别
1、信用不同。银行保函是由银行直接出具的，属于银行信用，而商业保函是由专业的担保机构或商业机构出具的，属于商业信用。
2、用途不同。银行保函多用于国际贸易，国内会比较少，属于国际担保业务，而商业保函多用于国内国家。
3、商业保函相对于银行保函要简单上许多，其不需要准备太多的资料，而且办理速度快，费用也比较低。
4、商业保函的格式条款相对于会灵活一些，而银行保函的格式就会比较严谨，不能随意更改。
什么是保函
保函又称保证书，是指银行、保险公司、担保公司或个人应申请人的请求，向第三方开立的一种书面信用担保凭证。银行出具的保证通常称为保函，其他保证人出具的书面保证一般称为保证书。保证在申请人未能按双方协议履行其责任或义务时，由担保人代其履行一定金额、一定期限范围内的某种支付责任或经济赔偿责任。保函即为保证书，为了方便，一般公司及银行都印有一定格式的保证书，其作用包括凭保函交付货物、凭保函签发清洁提单、凭保函倒签预借提单等。
凭保函交付货物的情况下，收货人保证在收到提单后立即向船公司交回全套正本提单，承担应由收货人支付的运费及其他费用的责任，对因未提交提单而提取货物所产生的一切损失均承担责任，并表明对于保证内容由银行与收货人一起负连带责任。凭保函签发提单则使得托运人能以清洁提单、已装船提单顺利地结汇。
关于保函的法律效力，海牙规则和维斯比规则都没有作出规定，考虑到保函在海运业务中的实际意义和保护无辜的第三方的需要，汉堡规则次就保函的效力问题作出了明确的规定，保函是承运人与托运人之间的协议，不得对抗第三方，承运人与托运人之间的保函，只是在无欺骗第三方意图时才有效；如发现有意欺骗第三方，则承运人在赔偿第三方时不得享受责任限制，且保函也无效。