无尘室系统
室内的空气净化系统可分为水平层流、垂直层流和乱流。选择气流形式一则参照惯例，二则取决于房间的工作参数。
洁净度与换气次数
房间的洁净度取决于单位时间的换气次数，因此慎密考虑房间的工作性质、以及生产工艺要求，再决定净化系统的技术参数。
净化空调系统没有清扫干净
在施工过程中，整个净化空调系统，尤其是送、回风管道都不是一次完成，施工人员和工环境都会造成通风管道和过滤器的污染。如不清洁干净，将直接影响检测结果。改进措施是，边施工边清洁，面前一段管道安装完成清洁后，可用塑料薄膜密封，避免环境等造成的污染。
房间需要密闭
无论正压或负压实验室，维护较高洁净度的设备运行效果需要良好的密闭性作为保证。正压实验室压力高于室外大气压，可以防止室外大气颗粒进入。但负压实验室则室外大气颗粒非常容易经过建筑不严密处向内渗透，需要靠实验室严密性和负压梯度来确保工作区洁净。
合理的气流组合
洁净实验室内的主要工作区处于洁净空气的上游方向，使得工作区域保持洁净状态。洁净室气流有层流（单向流）和乱流（非单向流）两个基本形式。层流洁净室自净能力强，涡流少，易保持洁净度；乱流洁净室涡流多，粒子在室内停留时间长，不适合高洁净度实验室。