蒙古黑石材由于本身存在着微孔，所以具有天然的透气性，而保持蒙古黑石材自然的透气性是至关重要的。
不同质地石材的微孔大小是不同的，石材的透气性的高低通常是由这些微孔的大小来决定的。保持石材这些微孔的畅通，石材内部的湿气才会挥发出来，石材由于潮湿的原因出现问题的机会就会比较少。但是正是石材这些微孔产生的毛细作用，会使石材有着不同的吸水率，石材表面上的水和液体污物也会渗入石材内对石材产生损害和污染。
对于蒙古黑石材来讲，过多的与水接触则是导致石材出现病变和损坏的主要原因，所以如何使石材既保持良好的透气性，又能避免液体渗入石材内部，这是做好石材保护的一个重要课题和内容。